Consejo de Gobierno (Comisiones)
El Consejo de Gobierno de la Universidad Loyola cuenta con cinco comisiones:
Comisión Académica
Presidente: Gabriel María Pérez Alcalá, Rector.
Coordinador: Pedro Pablo Pérez Hernández, Secretario General.
Comisión de Investigación
Presidente: Gabriel María Pérez Alcalá, Rector.
Coordinador: Carlos R. García Alonso, Vicerrector de Investigación.
Comisión de Identidad y Misión
Presidente: Gabriel María Pérez Alcalá, Rector.
Coordinador: José María Valverde Viqueira SJ, director del Servicio de Evangelización y Diálogo
Comisión Económica
Presidente: Gabriel María Pérez Alcalá, Rector.
Coordinador: Manuel Molina Trujillo, Gerente.
Comisión de Desarrollo
Presidente: Gabriel María Pérez Alcalá, Rector.
Coordinador: Francisco Amador, profesor de la Universidad Loyola.